出血性肠炎发病急，最常出現的最开始病症是忽然腹痛，多在脐周。病初常主要表现为慢慢加重的脐周或中上腹部阵发剧痛，之后慢慢变为全腹延续性痛，并有阵发加重。腹痛产生后就可以有腹泻。粪便始为粘稠而带粪质，之后渐为黄水样，随之即呈清水状或呈赤豆汤和苹果酱样，乃至可呈血水状或深红色血团，粪便少并且恶臭味。

出血是多少不确定，轻则可仅有腹泻，或仅为粪便隐血阳性而无大便出血；情况严重一天出血可达数百毫升。腹泻和大便出血时间较短者仅1～2天，年长者可达一数月，且可呈间歇性发病，或不断数次发病。腹泻情况严重可出現脱干和呼酸代谢性酸中毒等。除此之外恶心干呕常与腹痛、腹泻另外产生。排泄物能为黄水样、现磨咖啡样或血水样，也可以恶心呕吐胆液。

发病后就可以出現全身上下不适感、孱弱和发烫等全身上下病症。发烫，人体体温一般在38～39℃，极少数可达41～42℃，但发烫超过4～七天渐退，而不断2周以上者罕见。有非常少状况会出現腹腔饱涨、看到肠型。该状况脐周和上腹可有显著压疼。初期肠鸣音可较为亢奋，然后可变弱或消退。